DNA的復制是對那些堅持達爾文主義世界觀的的人們的一項基本挑戰。作為生物信息被復制并傳遞給后代的過程，這是一個對于細胞的自我復制過程必要的機制。細胞的自我復制對于任何選擇性的過程中都是必要的，比如自然選擇。因此，試圖用自然選擇來解釋這個機制巨大的復雜性需要人們先要假設他們想解釋的東西的客觀存在。 由于其極為復雜的性質，大多數生化學者先前認為該系統產生，是在最后一個共同祖先的起源之前。 此外，許多生化學家長久以來一直把在所有生命中觀察到的DNA復制的功能性的相似當作DNA復制的單一的起源。 不過在1999年，美國國家衛生研究院的研究人員證明，參與細菌和古細菌或真核細胞（生命進化之樹的兩個主干）的DNA復制的核心酶其實并沒有一個共同的進化起源。 因此，它看起來好像細菌和古細菌獨自產生了兩個相同的DNA復制系統 — 在這兩個進化的譜系據信分化自最后的共同祖先之后。
認為這一工程奇跡是一次形成的就已令人驚嘆的，更不用說兩次。沒有明顯的原因表明DNA復制是通過一個半保留的，RNA引物依賴性的，雙向的機制發生的，該機制依靠前置鏈和滯后鏈產生DNA后代分子。 即使DNA復制可以在兩個不同場合獨立地演變，考慮到他們的特性，有理由認為對于細菌和古細菌或真核細胞會出現根本不同的機制。但是沒有。