在減數分裂早期出現的四種染色單體中的兩種（前期I）彼此配對并且能夠相互作用。重組由雙鏈斷裂引發。其它類型的DNA損傷也可能引發重組。例如，交聯劑如絲裂霉素C引起鏈間交聯可以通過HRR修復，引發重組。
重組產物有兩種：染色體側翼區域被交換的“交叉”（CO）型和染色體側翼區域未被交換的“非交叉”（NCO）產物。CO型重組通過DHJ途徑形成兩個“Holliday junctions”，每個junction中兩個參與的染色單體之間都存在單鏈交換。NCO重組體通過稱為“合成依賴性鏈退火”（SDSA）的方法產生。 NCO / SDSA類型的重組事件似乎比CO / DHJ類型更常見 [4] 。