由于B 型流感嗜血桿菌在發酵過程中發酵液的組分極其復雜，包含大量的B型流感嗜血桿菌產生的蛋白質、核酸，以及其次級代謝產物和培養基中的各種成分等等。為了獲得安全有效的多糖，必須對蛋白質、核酸等雜質去除，獲得純度較高的莢膜多糖。其次，b型流感嗜血桿菌的莢膜多糖是由若干個核糖基核糖醇磷酸鹽組成的重復單位， 分子質量在一個較寬范圍內 [9] 。所以，必須對莢膜多糖進行純化，已獲得蛋白質、核酸等雜質含量低的莢膜多糖。
國產四聯疫苗采用精準的冷酚抽提條件，篩選出最合適的乙醇濃度沉淀核酸，并精確了沉淀次數，從而使莢膜多糖的濃度大幅度提升，產量大大增加，且各項指標均達到國家標準 [10] 。