DNA受損后,由于錯配修復的累積,導致基因組不穩定,遺傳信息發生改變。P53可參與DNA的修復過程,其DNA結合結構域本身具有核酸內切酶的活性,可切除錯配核苷酸,結合并調節核苷酸內切修復因子XPB 和XPD的活性,影響其DNA重組和修復功能。P53還可通過與P21 和GADD45形成復合物,利用自身的3’-5’核酸外切酶活性,在DNA修復中發揮作用。