農桿菌介導法起初只被用于雙子葉植物中，農桿菌的介導轉化在一些單子葉植物(尤其是水稻)中也得到了廣泛應用。此外，生物技術學家還可以通過發根農桿菌轉化，在液體培養基中培養高密度的根，作為一種在轉基因植物中獲得大量蛋白質的方法。
農桿菌Ti質粒的T-DNA可高效率地整合到植物受體細胞的染色體上并得到表達。利用這一特點，Marton等(1979)以植物原生質體為受體首創了“共培養法”(co-cultivation)。后來經過一系列改進，特別是Horsch等(1985)建立的“葉盤共培養法”(leaf discco-cultivation)，使這種轉化方法更加實用。
所謂“共培養法”是指將根癌農桿菌與植物的原生質體、懸浮細胞、葉盤、莖段等放在一起共同培養而實現轉化的方法。首先用打孔器從消毒的葉片上取得葉網片，亦稱之葉盤，將其放在對數生長期的農桿菌的菌液中浸泡數秒鐘后，置于培養基上共同培養2～3d。待葉盤周圍的菌株生長至肉眼可見菌落時，轉移到含有抑菌劑的培養基中除去農桿菌，同時在該培養基中加入抗生素進行轉化體選擇，經過3～4周的組織培養即可獲得轉化的再生植株。世界上已有的轉基閃植物，大多數是通過農桿菌介導法得到的 。