一.振蕩漂洗法：
將待測樣品浸泡于提取溶劑中，若有必要可加以振蕩以加速擴散，適用于附著在樣品表面的農藥以及葉類樣品中的非內吸性農藥。
二.勻漿萃取法：
將一定量的樣品置于勻漿杯中，加入提取劑，快速勻漿幾分鐘，然后，過濾出提取溶劑凈化后進行分析;
有時為了使樣品更具代表性，需加大樣品量，這時可先將大量樣品勻漿，然后，稱取一定量的勻漿后的樣品用萃取溶劑萃取，尤其適用于：葉類及果實樣品，簡便、快速。
三.索氏提取法：
索氏提取法是一種經典萃取方法，用于測量食品、飼料、土壤、聚合物、紡織品、紙漿和許多其他物質中的可提取物，在當前農藥殘留分析的樣品制備中仍有著廣泛的應用。美國環保署(EPA)將其作為萃取有機物的標準方法之一(EPA3540C);國標方法中也用使用索式提取法作為提取方法。由于是經典的提取方法，其它樣品制備方法一般都與其對比，用于評估方法的提取效率。
大多數農藥是脂溶性的，所以，一般采取提取脂肪的方法，將經分散而干燥的樣品用無水yi醚或石油醚等溶劑提取使樣品中的脂肪和農殘進入溶劑中，再凈化濃縮即可分析。
適用于谷物及其制品、干果、脫水蔬菜、茶葉、干飼料等樣品。無yi醚或石油醚等溶劑，提取效率高，操作簡便。
索氏提取法步驟：
稱取2～5g樣品到索氏樣品套管種，添加150mL溶劑到索氏燒瓶中，按每小時4～6循環萃取16～24小時，然后冷卻，對萃取液進行濃縮，再適當的溶劑進行復溶，進行儀器分析。
需要注意：
提取時間長，消耗大量的溶劑必須考慮被測物的穩定性;含水量過高的水果蔬菜不宜作為分析對象。
影響提取效果的因素主要有：
決定索氏提取效率的因素除了提取溶劑之外，還有就是提取溶劑的回流次數(在某種程度上可以說是提取時間)，料液比以及提取溫度等。
提取過程中的注意事項：
1.一般在實驗中水浴的溫度不能過高以防止暴沸造成目標物的損失;
2.在索氏提取中，裝樣品一般都是用濾紙筒，不宜使用金屬的篩筒(這會造成部分農藥目標物的分解，如，Fe可能會造成某些有機氯農藥分解)。此外，應注意濾紙筒在裝樣之后與提取器的匹配，尤其須注意紙筒不能堵塞虹吸回流管。
3.實驗中所使用的索氏提取器不宜過大，否則溶劑蒸氣到達提取器之前由于環境空氣的冷凝作用而減少(特別是冬天等環境溫度較低的時候)，從而減緩了提取效率，使得提取耗時過長。
4.由于索氏提取是一個相對開放的提取體系，因此，在提取操作中還應注意防止產生污染;實驗操作中zui好將冷凝管頂端進行覆蓋。
5.索氏提取管的清洗，一般可以用鉻酸洗液進行清洗，去離子水(可以在使用前多準備一些用正己烷萃取一下備用)在清洗干凈、烘干或者風干。
索氏提取方法的主要優點：
不需要使用特殊的儀器設備，儀器成本低，很多實驗室都可以得以實現、使用成本較低。
傳統索氏提取方法的主要缺點：
1.提取過程長，一般6～8小時以上;
2.玻璃器具易損壞，尤其是虹吸回流管很容易破損;
3.開放性系統，易出現溶劑泄露，污染環境;操作人員可能吸入較多溶劑;
目前，索氏提取已經發展出了自動索氏提取法(Automated Soxhlet Extraction Method)，EPA3541也有標準方法。相比與索氏提取，自動索氏提取法具有提取時間較快、操作自動化、溶劑可以回收等有點。
自動索式提取可以實現提取過程的自動化操作且優勢明顯：
快速加熱;無需人員看管;使用溶劑量**減少;至少比傳統索式提取快五倍;容積可回收等;
四.液-液萃取法
向液體混合物中加入某種適當溶劑，利用組分溶解度的差異使溶質由原溶液轉移到萃取劑的過程;
向溶液試樣加入非極性或水溶性的溶劑，用振蕩等方法來輔助提取試樣中的溶質;
適合液態樣品，或經過其他方法溶劑提取后的液態基質;常用非極性的溶劑有正己烷、苯、乙酸乙酯;常用的水溶性溶劑有二氯甲烷、甲醇、乙、丙酮以及水;
注意：
不需要昂貴的設備和特殊儀器，操作簡便;常用到大體積的溶劑，而在振蕩分配過程中則要控制溶劑體積，費時費力，容易引起誤差。
五.超聲波提取方法(超聲波輔助萃取法，Ultrasonic Extraction)
超聲波是一種高頻率的聲波，利用空化作用產生的能量，用溶劑將各類食品中殘留農藥提取出來;
將樣品放在超聲波清洗機，利用超聲波來促進提取適合液態樣品，或經過其他方法溶劑提取后的液態基質;適用溶劑包括甲醇，乙醇，丙酮，二氯甲烷，苯等，簡便，提取溫度低、提取率高，提取時間短;
1.提取原理
(1)機械效應
超聲波在介質中的傳播可以使介質質點在其傳播空間內產生振動，從而強化介質的擴散、傳播，這就是超聲波的機械效應。超聲波在傳播過程中產生一種輻射壓強，沿聲波方向傳播，對物料有很強的破壞作用，可使細胞組織變形，植物蛋白質變性;同時，它還可以給予介質和懸浮體以不同的加速度，且介質分子的運動速度遠大于懸浮體分子的運動速度。從而在兩者間產生摩擦，這種摩擦力可使生物分子解聚，使細胞壁上的有效成分更快地溶解于溶劑之中。
(2)空化效應
通常情況下，介質內部或多或少地溶解了一些微氣泡，這些氣泡在超聲波的作用下產生振動，當聲壓達到一定值時，氣泡由于定向擴散(rectieddiffvsion)而增大，形成共振腔，然后突然閉合，這就是超聲波的空化效應。這種氣泡在閉合時會在其周圍產生幾千個大氣壓的壓力，形成微激波，它可造成植物細胞壁及整個生物體破裂，而且整個破裂過程在瞬間完成，有利于有效成分的溶出。
(3)熱效應
和其它物理波一樣，超聲波在介質中的傳播過程也是一個能量的傳播和擴散過程，即超聲波在介質的傳播過程中，其聲能不斷被介質的質點吸收，介質將所吸收的能量全部或大部分轉變成熱能，從而，導致介質本身和藥材組織溫度的升高，增大了藥物有效成分的溶解速度。由于這種吸收聲能引起的藥物組織內部溫度的升高是瞬間的，因此可以使被提取的成分的生物活性保持不變。
此外，超聲波還可以產生許多次級效應，如，乳化、擴散、擊碎、化學效應等，這些作用也促進了植物體中有效成分的溶解，促使藥物有效成分進入介質，并于介質充分混合，加快了提取過程的進行，并提高了藥物有效成分的提取率。
注意：
1.超聲波提取器功率較大，噪音比較大，對容器壁的厚薄及容器放置位置要求較高，目前，僅在實驗室內使用，難以應用到大規模生產上。目前，實驗室使用較多的還是超聲波清洗器作為提取儀器。一般在超聲波提取之前應該將待提取樣品用提取溶劑浸泡一段時間，使之相互充分的接觸、滲透。在超聲波提取中，zui好都是使用混合提取溶劑，分步驟提取，以提高目標物的提取效率。
2.對玻璃容器也有一定的要求，如果玻璃容器的質地不好，有裂隙等，在提取過程中很容易破裂，因此，在選擇玻璃器皿時應特別注意。
3.有機溶劑在使用超聲波提取時，揮發性會增強，污染環境，要注意提取容器不能密閉，應有一定的空間。
4.使用超聲波清洗器進行提取，需注意在整個超聲容器中超聲波場的分布是不均勻的，類似在波場的分布中有死角，這會使得部分樣品的提取效率顯著下降，從而導致重現性較差。
5.超聲波提取所需要的溶劑量較大，一般都是分步提取、過濾。雖然操作簡單但是操作的勞動強度較大，而且需要進行過濾等步驟將提取溶劑與樣品分離。
六.固相萃取法
利用吸附劑對待測組分與干擾雜質的吸附能力的差異，在層析柱中加入一種或幾種吸附劑，再加入測樣本提取液，用淋洗液洗脫。適用于分離保留性質差別很大的化合物;常用吸附劑包括氟羅里硅土，氧化鋁，硅藻土等。
優缺點：
操作簡單，適用面廣;有機溶劑的使用量較大，且不適于大批量樣品的前處理。