農藥殘毒檢測儀基于酶促反應動力學原理，被測樣品如含有機磷類或氨基甲酸酯類農藥，將會抑制膽堿酯酶的活性，影響顯色體系的反應速度，通過測定顯色體系吸光度隨時間的變化率來測量待測樣品中的農藥殘留量（抑制率）。_有機磷和氨基甲酸酯類農藥對膽堿酯酶正常功能有抑制作用，其抑制率與農藥的濃度呈正相關系。正常情況下，酶催化神經傳導代謝產物(乙酰膽堿)水解，其水解產物顯色劑反應，產生黃色物質，用農藥殘毒檢測儀器測定吸光度隨時間的變化值，計算出抑制率，通過抑制率可以判斷出樣品中是否含有有機磷或氨基甲酸酯類農藥的存在。