凝縮蛋白在染色體組裝和壓縮中起著至關重要的作用，但其實現功能的機制尚不清楚。一種觀點是這種蛋白隨機地抓住雜亂的DNA的某個地方，將這些DNA系在一起；另一種觀點是這種蛋白將DNA向內擠壓，產生一種環，2017年以標題“The condensin complex is amechanochemical motor that translocates along DNA”發表在Science上的研究支持這種環擠壓（loop-extrusion）觀點。
研究人員使用單分子成像（single-molecule imaging）技術證明釀酒酵母凝縮蛋白具有這種機制所需的馬達功能，它能夠沿著DNA進行依賴于ATP水解的移動。凝縮蛋白的移動是快速的，并且前進能力很強，單個復合物能以每秒60堿基對的速度移動平均距離不少于1萬堿基對。凝縮蛋白的步長可能與其約50納米的卷曲螺旋（coiled-coil）亞基相當，表明其移動機制不同于任何之前報道的DNA馬達蛋白。