一般分為三個步驟：裝柱、加樣、洗脫淋洗。
裝柱是需要注意的是：【1】垂直放置 【2】放置產生氣泡 【3】放置柱分層
加樣時，【1】加樣前打開出口，使展開劑流出，至正好露出凝膠上平面時，立即關閉出口
【2】加樣時，用滴管緩緩沿柱內壁加入柱子
【3】打開柱子得出口，使待分離的樣品進入柱子。
加樣完成后，進行洗脫。
