分子排阻色譜法又稱空間排阻色譜法（SEC）是利用多孔凝膠固定相的獨特性產生的一種，主要根據凝膠孔隙的孔徑大小與高分子樣品分子的線團尺寸間的相對關系而對溶質進行分離的分析的方法。分子排阻色譜又叫凝膠色譜法。
分子排阻色譜法是根據分子大小進行分離的一種 液相色譜技術。分子排阻色譜法的 分離原理為 凝膠色譜柱的 分子篩機制。 色譜柱多以親水硅膠、凝膠或經修飾凝膠如 葡聚糖凝膠Sephadex和 聚丙烯酰胺凝膠Sepherose等為 填充劑，這些填充劑表面分布著不同尺寸的 孔徑，藥物分子進入色譜柱后，它們中的不同組分按其大小進入相應的孔徑內，大小大于所有孔徑的分子不能進入填充劑顆粒內部，在色譜過程中不被保留，最早被 流動相洗脫至柱外，表現為保留時間較短；大小小于所有孔徑的分子能自由進入填充劑表面的所有孔徑，在柱子中滯留時間較長，表現為保留時間較長；其余分子則按分子大小依次被洗脫。