兒童慢性的咳嗽常存在一些潛在的疾病，較為常見的有先天性或繼發性免疫功能缺陷、纖毛運動障礙、氣道畸形、哮喘、支氣管擴張、慢性鼻竇炎、增殖體炎、鼻后滴漏或重癥肺炎（重癥毛細支氣管炎、腺病毒肺炎、麻疹肺炎和肺炎支原體感染）以后。病原以病毒和細菌居多。也可由于長期吸入有毒煙塵，使呼吸道防御功能減弱而發生。
