沒有人準確知道腳不寧癥肢動癥的病因，以下全是推測：
腳不寧癥肢動癥主要原因是腿部神經興奮，造成患者感覺腿部酥癢難忍，甚至疼痛感，據推測有以下可能：
1、營養不良，缺乏某種金屬成份
2、藥物中毒，長期食用某種藥物所致，如一些抗抑郁癥藥物
3、缺乏運動
4、家庭遺傳（超過60%遺傳）
5、周邊神經退化
6、其他疾病引起的，例如睡眠呼吸中止癥、糖尿病、昏睡癥、巴金森氏癥、創傷后壓力癥等等。缺鐵血性貧血，尿毒癥，或女性懷孕時都會加重癥狀，咖啡因和酒精也會加重病情。
