切口平移法的缺點：
1.放射物質攝入率較低；
2.長時間反應后在DNA Pol I的外切酶活性的作用下，將已經摻入的放射性物質游離下來，降低了攝入率；
3.必須有高純度的模板DNA；
4.反應后必須除去未反應的放射性dNTP。
