此外，在調節作用上，別構調節多半以影響關鍵酶（代謝轉折點的酶）使代謝發生方向性的變化為其主要作用；化學修飾調節則以放大效應調節代謝強度為主要作用。但也應看到它們的作用是相輔相成的，不可截然劃分。有時這兩種調節方式可以共存。有些酶具有別構與化學修飾雙重調節。
（1）絕大多數屬于這類調節方式的酶都具無活性（或低活性）和有活性（或高活性）兩種形式。它們之間在兩種不同酶的催化下發生共價修飾，可以互相轉變。催化互變反應的酶在體內受調節因素如激素的控制。
（2）和變構調節不同，化學修飾是由酶催化引起的共價鍵的變化，且因其是酶促反應，故有放大效應。催化效率長較變構調節高。
（3）磷酸化與脫磷酸是最常見的酶促化學反應。