可分為工業用大規模制備純物質的生產制備色譜和實驗室分離幾毫克至幾克樣品，以便鑒定色譜圖中未知峰的小型制備色譜。
實驗室制備色譜除了用柱色譜外還有制備薄層色譜。由于樣品處理量大，制備色譜要求色譜柱具有一定的容量和效率，以分離收集純組分。
同時也要考慮分離速度，而進樣和檢測器這兩部分與分析色譜大致相似。
制備色譜法可以完成一般分離方法難以完成的純物質制備，如純化學試劑、合成中間體、蛋白質的純化等。
