1. 在微量離心管中混勻下列試劑,配制DNA摸板混合物 (1)1 μg 單鏈DNA模板或1~3 μg 變性雙鏈DNA模板
(2)0.5 pmol 生物素酰化DNA測序引物
(3)2 μl 5×Bst反應緩沖液
(4)加水至11 μl
(5)加熱至70℃,然后在30 min 以上的時間內,慢慢冷卻至30 ℃
2. 當模板混合物冷卻的同時,各取2 μl 小份的A、C、T、G引物終止混合液,加于4個獨立的微量離心管或微量滴定板的孔中,然后做好A、C、G、T的標志。
3. 在65℃預熱盛有終止混合物的管子或滴定板。
4. 加入1 μl Bst DNA聚合酶于步驟1冷卻后的模板混合物中。
5. 步驟2準備好的每個引物終止混合物中,各加入2.5 μl 聚合酶/模板混合液,于65℃溫育5 min。 6. 用水將20×追加溶液貯液稀釋成1×追加溶液,往每個樣品管或孔中各加入2 μl 1×追加溶液,于65℃溫育5 min。
7. 各管或孔中加入4 μl終止溶液。 8. 準備好標準的0.2~0.4 mm 厚含8 mol/l 尿素的測序膠。
9. 加樣前,樣品于80℃溫育2 min,置于冰浴,加樣2~3 μl,電泳,監測示蹤染料的遷移。 10. 剪三張與凝膠大小剛好或稍大的Whatman 3MM 濾紙,剪下一片能蓋過凝膠需轉移 區域的尼龍膜。 11. 拆卸凝膠裝置,分開玻璃平板。
12. 將一張Whatman 3MM 干濾紙放于凝膠上,然后通過剝起濾紙小心將凝膠揭起。
13. 將貼著凝膠的濾紙,膠面朝上放在玻璃平板上。
14. 將尼龍膜浸沒TBE緩沖液中,或用噴水瓶噴射TBE緩沖液使之完全潤濕。
15. 小心將濕潤的膜放在凝膠上,用吸管或平滑的玻璃棒在膜上滾動以排去氣泡。
16. 在膜的上面放兩張Whatman 3MM 干濾紙,濾紙上放另一塊玻璃平板并在其上加以2~4 kg 重物,轉移1 h。
17. 分離測序膠/膜夾層,小心從凝膠上剝下膜,并用鉛筆在膜與凝膠接觸的一面作好標志,將膜放在濾紙上,晾干約10 min。
18. 使用紫外線交聯裝置,紫外透照儀或手恃式紫外燈,照射轉印膜以固定DNA,總紫外線照量為120 MJ/cm2。
19. 接著進行步驟20的操作或將膜放在兩層保鮮膜之間,在 4 ℃可保存6個月。 20. 將膜放入可加熱封閉的大袋子中,加入500 ml 封阻液Ⅰ,小心排去氣泡,密封口袋,放置10 min。
21. 按下述過裎處理膜 (1)200 ml 偶聯物緩沖液20 min
(2)500 ml 封阻液15 min
(3)500 ml 洗滌緩沖液Ⅰ10 min,3次
(4)500 ml 分析緩沖液2 min
(5)50 ml 二氧雜環丁烷檢測5 min
21. 從袋子中排出過量的檢測液,平整所有的皺折,重新密封口袋。
22. 室溫將包著的膜直接與X光感光片接觸使之曝光。
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