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  • 發布時間:2019-03-26 15:03 原文鏈接: 化學發光雙脫氧DNA測序實驗

    標準的雙脫氧DNA測序可以很容易和很有效地使用非同位索標記的化學發光法進行檢測。在測序反應中,使用生物素標記的引物。用非同位素標記如生物素衍生化的引物,可用于為5’-末端標記引物而設的入測序反應的工作方案。


    實驗材料

    DNA

    試劑、試劑盒

    生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPdTTP

    儀器、耗材

    熱循環儀尼龍膜濾紙離心機

    實驗步驟

    1.  在微量離心管中混勻下列試劑,配制DNA摸板混合物


    (1)1 μg 單鏈DNA模板或1~3 μg 變性雙鏈DNA模板

    (2)0.5 pmol 生物素酰化DNA測序引物

    (3)2 μl 5×Bst反應緩沖液

    (4)加水至11 μl


    (5)加熱至70℃,然后在30 min 以上的時間內,慢慢冷卻至30 ℃

    2.  當模板混合物冷卻的同時,各取2 μl 小份的A、C、T、G引物終止混合液,加于4個獨立的微量離心管或微量滴定板的孔中,然后做好A、C、G、T的標志。

    3.  在65℃預熱盛有終止混合物的管子或滴定板。

    4.  加入1 μl Bst DNA聚合酶于步驟1冷卻后的模板混合物中。

     

    5.  步驟2準備好的每個引物終止混合物中,各加入2.5 μl 聚合酶/模板混合液,于65℃溫育5 min。

     

    6.  用水將20×追加溶液貯液稀釋成1×追加溶液,往每個樣品管或孔中各加入2 μl 1×追加溶液,于65℃溫育5 min。

    7.  各管或孔中加入4 μl終止溶液。

     

    8.  準備好標準的0.2~0.4 mm 厚含8 mol/l 尿素的測序膠。

    9.  加樣前,樣品于80℃溫育2 min,置于冰浴,加樣2~3 μl,電泳,監測示蹤染料的遷移。

     

    10.  剪三張與凝膠大小剛好或稍大的Whatman 3MM 濾紙,剪下一片能蓋過凝膠需轉移 區域的尼龍膜。

     

    11.  拆卸凝膠裝置,分開玻璃平板。

    12.  將一張Whatman 3MM 干濾紙放于凝膠上,然后通過剝起濾紙小心將凝膠揭起。

    13.  將貼著凝膠的濾紙,膠面朝上放在玻璃平板上。

    14.  將尼龍膜浸沒TBE緩沖液中,或用噴水瓶噴射TBE緩沖液使之完全潤濕。

    15.  小心將濕潤的膜放在凝膠上,用吸管或平滑的玻璃棒在膜上滾動以排去氣泡。

    16.  在膜的上面放兩張Whatman 3MM 干濾紙,濾紙上放另一塊玻璃平板并在其上加以2~4 kg 重物,轉移1 h。

    17.  分離測序膠/膜夾層,小心從凝膠上剝下膜,并用鉛筆在膜與凝膠接觸的一面作好標志,將膜放在濾紙上,晾干約10 min。

    18.  使用紫外線交聯裝置,紫外透照儀或手恃式紫外燈,照射轉印膜以固定DNA,總紫外線照量為120 MJ/cm2。

    19.  接著進行步驟20的操作或將膜放在兩層保鮮膜之間,在 4 ℃可保存6個月。

     

    20.  將膜放入可加熱封閉的大袋子中,加入500 ml 封阻液Ⅰ,小心排去氣泡,密封口袋,放置10 min。

    21.  按下述過裎處理膜


    (1)200 ml  偶聯物緩沖液20 min

    (2)500 ml  封阻液15 min

    (3)500 ml  洗滌緩沖液Ⅰ10 min,3次

    (4)500 ml  分析緩沖液2 min

    (5)50 ml 二氧雜環丁烷檢測5 min


    21.  從袋子中排出過量的檢測液,平整所有的皺折,重新密封口袋。

    22.  室溫將包著的膜直接與X光感光片接觸使之曝光。


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