中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Research上。
Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化數據。作為表觀修飾的重要組成部分，DNA甲基化在人類疾病與衰老、動物胚胎發育以及植物生長發育過程都起重要作用。MethBank 3.0提供了4577個健康人外周血樣本的450K芯片數據，并編審成34個不同年齡組的參比甲基化組（consensus reference methylomes，CRMs）；提供不同年齡組健康人基因組胞嘧啶位點甲基化水平的分布范圍，整合5個重要經濟作物（水稻、大豆、木薯、菜豆和番茄）不同發育階段多個組織的336個單堿基精度甲基化組（single-base resolution methylomes，STMs）和兩個模式動物（斑馬魚和小鼠）的配子與早期胚胎發育的18個單堿基精度甲基化組。相比于之前版本，MethBank 3.0有更加詳細、系統的注釋與分析，識別了692個年齡相關甲基化位點、2371個與年齡無關的位點、304886個差異甲基化啟動子（DMPs）、53680個年齡特異的甲基化位點（age-specific DMCs）、1716個年齡特異的甲基化區域（age-specific DMRs）以及693825個甲基化的CpG島。此外，Methbank 3.0提供兩個分析工具（Age Predictor和IDMP）分別用于預測人的甲基化年齡和識別差異甲基化啟動子。
Methbank 3.0配備友好的瀏覽、查詢與可視化功能，用戶可通過基因ID/ymbol、基因組位置等檢索甲基化信息，瀏覽指定物種差異甲基化啟動子或高甲基化CpG島，通過ftp下載所有相關注釋數據與分析結果。
研究工作得到了中科院戰略性先導科技專項、中科院國際合作計劃、國家科技攻關計劃、國家高技術研究發展計劃（863計劃）、中科院百人計劃等的資助。
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所（嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室深圳分中心）和佛山鯤鵬現代農業研究院研究員唐中林團隊在國際期刊《腸道微生物》（GutMicrobes）上發表論文。該研究揭示......
記者10月6日從華中農業大學獲悉，該校棉花遺傳改良團隊開發出基于CRISPR/dCas13（Rx）的新型植物RNA甲基化編輯工具。研究成果日前發表于《先進科學》雜志。N6-甲基腺苷（m6A）是真核生物......
DNA甲基化是表觀遺傳修飾的重要組成部分，可以通過改變染色質的結構、DNA的穩定性以及DNA和蛋白質的結合程度調控基因表達。在植物DNA甲基化的建立和維持過程中，植物特有的RNA聚合酶V（PolV）通......
植物是復雜的生物系統。植物體內基因的表達受到多種水平的調控，如轉錄水平、轉錄后水平、DNA甲基化/去甲基化等，從而對基因表達進行精密高效的調控。中國科學院遺傳與發育生物學研究所張勁松研究組篩選OsEI......
時間如梭，衰老是自然界不可抗拒的規律，但衰老的步伐并非一成不變——即使在同齡人之間，生理功能的衰退和器官老化的程度也存在顯著差異。這些差異性說明個體的生物學年齡，即生理狀態所反映的年齡，可能與其實際年......
中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員石建濤，聯合上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院教授方海，在《基因組研究》（GenomeResearch）上，在線發表了題為ADNAmethylationhaplot......
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初級生產力中貢獻卓著，是頗有前景的合成生物學底盤細胞。為了探索工業固碳產油微藻的表觀遺傳機制和生理作用，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心以海洋微擬球藻......
9月14日，《自然-通訊》（NatureCommunications）在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心石建濤組完成的最新合作研究成果（DNAmethylationprofilingtode......
自閉癥（ASD）和精神分裂癥（SCZ）是常見的慢性精神疾病，在行為、遺傳學和神經病理學等方面存在相當多的重疊特征，提示自閉癥和精神分裂癥可能存在共同的神經發病機制。衰老與表觀遺傳效應的動態變化密切相關......
衰老，是一個復雜、多階段、漸進的過程，發生在生命的整個過程。隨著時間的流逝，人體的器官、肌肉會逐漸衰老，一些疾病也伴隨著年齡的增長而發生，包括癌癥、糖尿病、心血管疾病等。DNA甲基化，是一種DNA上的......