
10月27日下午,中國科學院北京基因組所組織召開了“北京基因組研究所計算生物學研討會”,會議由所長吳仲義主持,書記楊衛平、副所長李俊雄、基因組所生物信息研究人員以及科技處相關人員參加了會議。
研討會上,與會學者就目前計算生物學領域中涉及如何運用大規模高效的理論模型和數值計算來識別基因組序列中代表蛋白質的編碼區,破譯隱藏在核酸序列中的遺傳語言規律,基因組遺傳語言信息釋放及其調控相關的轉錄譜等問題展開了討論,會議還對目前基因組所計算資源和腫瘤基因組、個人基因組等生物信息未來重點研究領域以及醞釀成立“基因組所生物超算和生物信息研究中心”并就中心未來的發展目標、管理模式和人才引進等眾多方面進行了熱烈討論。
計算生物學是隨著人類基因組計劃的研究而起步,目前已成為現代生物學研究的核心方法之一。計算生物學運用大規模高效的理論模型和數值計算來基因組學極高通量數據產出特點使得對其海量數據分析,挖掘、管理及整合已成為計算生物學的中心問題之一。當前高性能計算集群,云計算,網格計算和異構計算都因基因組學這一巨大計算需求推動而得到普遍的應用。根據超出摩爾定律的基因組學數據增長速度預計,未來的個體化醫療所產生的基因組數據使得基因組學將面臨著與高能物理研究相同規模的海量數據分析和管理的挑戰。然而由于基因組學中的計算和存儲問題又與高能物理等領域中的計算和存儲問題具有非常迥異的特點。成立生物超算和生物信息研究中心,使得基因組所能著力研究在計算生物學特別是基因組信息學中海量數據分析與管理整合計算方法、技術和策略問題,為未來的基因組醫藥和個體化醫療面臨的計算問題提供有力的方法學保障,同時由基因組學內在需求驅動的對計算方法技術的研究也能帶動整個計算生物學和高性能計算技術的發展,這也為在國家戰略層面建立中國在基因組學和計算生物學的取得領先優勢墊定堅實有力的基礎。
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