北京基因組所揭示RNA甲基化調控基因剪接機制

　　中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂課題組在研究m6A甲基化修飾調節mRNA選擇性剪接規律過程中，發現了讀碼器YTHDC1通過招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時抑制剪接因子SRSF10與RNA的結合，促進外顯子被保留的分子機制。該研究結果于2016年2月在Molecular Cell 雜志在線發表。

　　研究團隊通過串聯親和沉淀的方法篩選YTHDC1的互作蛋白，發現與其相互作用的兩個mRNA剪接因子SRSF3（SRp20）和SRSF10（SPp30c），結合轉錄組和光交聯-RNA測序及生物信息技術，證明YTHDC1和SRSF3傾向于促進外顯子保留，但SRSF10則傾向于促進外顯子的剪接。YTHDC1通過促進SRSF3，同時抑制SRSF10的核小斑定位及它們結合RNA的能力來調控mRNA選擇性剪接，而且只有野生型的YTHDC1能夠回補因敲低YTHDC1引起的SRSF3和SRSF10 核小斑定位、RNA結合能力和靶基因mRNA選擇性剪接變化。

　　結合研究團隊前期參與發現的RNA甲基化修飾酶（Jia et al. Nature Chemical Biology 2011； Zheng et al. Molecular Cell 2013； Ping et al. Cell Research 2014）及其甲基化位點選擇性機制(Chen et al. Cell Stem Cell 2015)和m6A修飾外顯子被保留現象(Zhao et al. Cell Research 2014)，m6A讀碼器YTHDC1調控mRNA剪接分子機制的闡明，為進一步研究m6A的生物功能和RNA表觀遺傳提供依據，為研究與正常生理（如干細胞干性維持和分化）或異常病理生命活動（如惡性腫瘤等）關聯的分子機理提供新的表觀調控研究方向。

　　該項研究得到科技部、國家自然科學基金和中科院先導專項等項目的支持。

YTHDC1調控mRNA選擇性剪接