北京大學Nature子刊發布表觀遺傳新成果

　　來自北京大學的研究人員報告稱，他們通過全轉錄組繪圖揭示出了可逆及動態的N1甲基腺苷(N1 methyladenosine,m1A)甲基化組。這一重要的研究成果發布在2月10日的《自然化學生物學》（Nature Chemical Biology）雜志上。

　　北京大學生命科學學院伊成器(Chengqi Yi)研究員是這篇論文的通訊作者。伊成器博士的主要研究領域是通過化學生物學、結構生物學、高通量測序等手段，對核酸修飾的生物功能及其生理調控機制進行研究。

　　2015年伊成器研究員領導課題組取得多項突破性研究成果，一系列相關論文發表在Nature子刊雜志上。6月，伊成器領導北京大學的研究人員采用化學下拉（pulldown）方法揭示出了哺乳動物轉錄組的動態假尿嘧啶化 (pseudouridylation)。這一重要的研究成果發布Nature Chemical Biology雜志上（北京大學Nature子刊解析表觀遺傳修飾）。8月，伊成器研究員與羅徹斯特大學的Yi-Tao Yu、加州大學的John Karijolich合作，在權威期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology 上發表文章，探討了RNA假尿嘧啶化在轉錄組中的動態（北大學者發表Nature綜述解析RNA修飾 ）。9月，其與芝加哥大學的何川教授合作，開發出了一種非重亞硫酸鹽方法，并利用這種方法以單堿基分辨率分析了小鼠胚胎干細胞（mESCs）中的全基因組5 -胞嘧啶甲酰（5-formylcytosine，5fC）。這一重要的研究成果發布Nature Methods雜志上（北京大學Nature Methods發布表觀遺傳重要成果）。

　　在最新的Nature Chemical Biology論文中，伊成器研究員與合著者指出m1A是一種普遍存在的轉錄后RNA修飾，但當前對于它在mRNA中的豐度、拓撲結構及動態情況知之甚少。他們在新研究中證實m1A普遍存在于人類mRNA，m1A/A比例為~0.02%。

　　基于m1A免疫沉淀法及m1A具有阻止逆轉錄的能力，研究人員開發出了一種m1A-ID-seq技術來進行全轉錄組m1A分析。m1A-ID-seq在mRNA和非編碼RNA中鑒別出了來自600個基因的901個m1A峰，并揭示出了突出的特征：不同于最豐富的哺乳動物mRNA 修飾N6甲基腺苷（m6A），m1A富集于mRNA轉錄物的5′非翻譯區。并且一種已知的DNA/RNA去甲基化酶ALKBH3可以消除mRNA中的m1A。最后，他們證實m1A甲基化作用動態響應刺激，還鑒別出了數百個壓力誘導的m1A位點。

　　作者們表示，他們開發出的新方法使得可以綜合分析m1A修飾，為研究通過可逆及動態的m1A甲基化作用實現的潛在表觀遺傳調控的功能提供了寶貴的工具。