醫用純水機的反滲透（RO）技術是一項膜分離技術。它以壓力為推動力，利用反滲透膜的選擇透性（只能透過水而溶質不能透過），達到將水和有機物、無機物分離的目的，制備純水和高純水。反滲透膜表面微孔尺寸一般在0.5~1um左右，其孔徑遠遠小于細菌、病毒的尺寸。所以，利用反滲透膜能祛除水中98%以上的溶解性固體，100%的細菌、病毒。反滲透對水的分離是物理分離。因此，只需消耗少量的電能以提供反滲透操作所需的滲透壓即可達到分離水和其他微粒的目的。
壓力蒸汽滅菌器是在高溫和高壓的作用下，進行的滅菌。需要對水進行加熱。日常的自來水、飲用水是不可以適用的。因為其中含有很多的鉀鈣鎂離子。加熱會后形成日常的“水銹”。損傷機器壽命。其次滅菌過程中，這些離子可能會沾染到滅菌物品的內壁和外壁，造成器械污染。
所以壓力蒸汽滅菌器和脈動真空滅菌器進行滅菌時，一定要使用處理過的水。例如醫用純水機處理的水、蒸餾水。