(1)糾正內穩態失衡：十二指腸外瘺發生以后，由于是高位瘺，因此也多是高流量的瘺，可以迅速發生內穩態失衡。應根據腸液的流失量及時從靜脈補給適量的液體與電解質。流量大者每天的液體需要量可以在7000～8000ml或更多，單是腸液的流失量就可達5000～6000ml。這時應采用腔靜脈置管輸液，既能保證液體的輸入，又可輸入大量的電解質如氯化鉀等。
(2)出血：在盡可能了解出血部位與原因的基礎上采取有效的止血措施：
①分流與抑制腸液：漏出腸液特別是胰蛋白酶等對腸黏膜及周圍組織消化腐蝕是造成出血重要原因。故抑制腸液和分流胃腸、膽胰液是預防與治療腸瘺出血的方法之一。A.用滴水雙腔負壓吸引管(黎氏管)主動引流液；B.給予生長抑素，抑制消化液的分泌，從而減少消化液經瘺口引流。
②手術與介入止血：可行再次剖腹手術縫扎出血點、X線透視指引下行選擇性動脈栓塞術。
③促進凝血與血管收縮：全身使用立止血，局部使用凝血酶、去甲腎上腺素溶液沖洗，堿化胃液。
(3)控制感染：十二指腸外瘺并發的感染，早期以腹膜炎為主，中后期以腹腔膿腫和腹腔內臟器感染為主，如十二指腸后壁瘺引起的蜂窩組織炎與壞死，脾膿腫、胰腺膿腫等。亦有病人是在腹腔內感染的基礎上發生腸瘺。腸瘺與腹腔內感染同時存在，形成惡性循環。因此正確處理腹腔感染是提高腸外瘺病人治愈率的關鍵。
①經皮膿腫穿刺引流(PAD)：腸瘺并發的腹腔感染多是以膿腫形式存在，PAD技術是腹腔膿腫治療的首選措施。其要點是在B超、X線透視或CT引導下經皮穿刺膿腫，明確診斷后置管引流膿液。亦可經置管注入無菌生理鹽水沖洗膿腔。對膈下膿腫、腹腔各間隙的膿腫和實質性臟器的膿腫均可使用。PAD技術可治愈單室膿腫，對多室膿腫，經反復多部位穿刺，治愈率也可達65%～9O%。對一般情況極差的腸外瘺病人均可起到暫時緩解病情，改善臟器功能的目的，為進一步的手術創造時機。
②再次剖腹手術與腹腔沖洗：對于極廣泛的腹腔感染或膿腫穿刺引流不甚滿意的十二指腸外瘺病人需再次行剖腹手術。通過手術去除感染源，清除壞死組織，去除膿液。在術中還要進行廣泛的腹腔沖洗，于術后放置引流管以便于術后進行持續的負壓沖洗引流。
過去認為腹腔沖洗會導致感染的擴散，因此反對術中腹腔沖洗。現在認為，針對腹腔感染的腹腔沖洗必須量大、徹底。量大，即腹腔沖洗液量應達到1 50～200ml/kg(體重)；徹底，即對腹腔的各個部位包括各潛在間隙進行廣泛的沖洗。在觀察到了腹腔沖洗的好處之后，亦有作者主張多次有計劃剖腹沖洗。但這一方法對臟器功能特別肺功能和腎功能的影響較大，對臟器支持水平要求較高。由于反復多次手術，造成病人分解代謝持續，營養支持也很難起到很好的作用，因此，有計劃多次剖腹沖洗并不適于廣泛的推廣應用。
通過動物實驗證實了腹腔沖洗可明顯減少腹腔內細菌的數繁，且對電解質無明顯的影響。近3 O年來的臨床實踐也證實，腹腔沖洗輔以術后持續的負壓引流行之有效，多可達到清除感染的目的。
③腹腔開放療法：對于極為嚴重的腹腔感染，估計一次手術及繼之的引流不能解決的感染，還可采用腹腔開放療法，亦稱腹腔造口(laparotomy)，如重癥胰腺炎或嚴重多發傷并發十二指腸外瘺所合并的嚴重腹腔感染。由于嚴重腹腔感染引起腹內壓增加出現腹腔間隙綜合征(abdominal compartment syndrome)也需行腹腔開放療法。
腹腔開放療法最大的好處是開放了腹腔，緩解了腹腔內的壓力，有利于預防和治療呼吸和腎功能的障礙。由于腹腔處于開放狀態，也便于在床旁清除壞死組織，直視下處理出血部位。不足的是繼發的腸外瘺和后期的腹壁缺損使后期的重建手術十分復雜。等待最后重建手術的時間平均在100天以上，最長者達8個月以上。臨床施行這一措施需十分謹慎。
為避免腹腔開放療法后腸管外露導致腸外瘺和切口疝，可采用暫時性的腹腔關閉技術。即在行開放療法的同時，使用人工材料如滌綸布，聚丙烯網覆蓋在敞開切口上。這樣，既可達到減輕腹內壓的作用，又可防止傷口無限制的擴大，預防腹壁缺損和腸外瘺的發生。對于經開放療法后腹腔感染迅速消退的腸外瘺患者，也可在確保引流通暢的情況下，短期內(7～14天)縫閉腹腔，避免持續開放療法的不足。后者也稱為暫時性腹腔開放療法。
④注重引流部位與引流方式：腸外瘺病人合并感染經久不愈的另一原因就是引流部位與方式不盡合理。有些病人僅僅因為改變了引流方式，腹腔感染問題就迎刃而解。有必要在此強調要重重視腹腔感染病人的引流。
國內各級醫院對于腹部手術后的引流物多種多樣。但在發生腸外瘺后，一些引流手段就顯得不足。一般的乳膠管、硅膠管極易堵塞，造成引流不暢。煙卷引流在感染伊始就很難達到引流的目的，造成腸液和膿液在體內積聚，加重腹腔感染。
使用滴水負壓吸引雙套管治療腸外瘺并發的腹腔感染行之有效。其原理是變被動引流為主動引流；變單純引流為滴水沖洗引流，可防止引流局部形成真空和導管堵塞。
⑤合理使用抗生素：腸外瘺并發的腹腔感染與殘余感染引流不充分、廣譜抗生素的使用、重癥監護病房內獲得性感染和腸道菌群易位有關。因此還應重視抗生素的合理使用及免疫微生態營養。
在腹腔感染手術治療的同時要注意抗生素的合理使用。在感染初發時，可根據感染的臨床特點與膿液性質及既往的治療用藥，經驗性使用抗生素，同時要行有關體液的細菌培養與藥敏試驗。以后可根據治療反應和細菌培養結果調整抗生素使用。對于細菌培養結果應定期進行統計分析，供經驗性用藥參考。在感染得到有效引流的情況下，無需持久給予抗生素以免細菌產生耐藥性導致二重感染。
十二指腸外瘺合并的腹腔感染與一般的腹腔感染相比，有其共性亦有其個性。腸外瘺合并的腹腔感染若不能及時處理。還會伴隨有出血、營養不良等并發癥，且會形成惡性循環。去除感染源，治療感染是阻斷這一惡性循環的關鍵。諸多措施中手術治療極為關鍵。這些感染處理方法也適于其他的嚴重腹腔感染。