半纖維素酶在速溶咖啡生產中應用極廣。常規法生產速溶咖啡是將咖啡豆提取液濃縮后直接進行冷凍干燥或噴霧干燥,由于咖啡豆中含有大量的半乳甘露聚糖,從而造成提取過程中粘度過大,給隨后的濃縮和干燥帶來困難。
使用甘露聚糖酶可以分解咖啡中的半乳甘露聚糖產生低聚糖,因此可大大降低咖啡的粘度,而粘度的降低可使生產中濃縮和干燥效率成倍提高,相應也就降低了速溶咖啡的生產成本。在谷物食品(主要是面包)上,半纖維素酶也體現了其獨特的應用價值。面包食品的諸多特性在很大程度上受谷物面粉中戊聚糖和淀粉含量的影響,應用木聚糖酶可以水解谷物面粉中的木聚糖產生木寡糖,從而大大改善了面包的質地、結構和松軟度。