HapMap還將產生截止2013年尚很難預料的知識上的進展。未來可以在患者的遺傳構成的基礎上實現個體化醫療,從而得到最好的效果并將副作用降至最低。與長壽和抗病能力有關的遺傳變異將被確定,從而產生具有廣泛益處的新療法。對任何新知識而言,HapMap既帶來新的挑戰,又帶來不可預料的空前的機遇。