要判斷是滯是皰疹性腦炎，一般得根據臨床表現和實驗室檢查結果，如果出現以下結果，得高度懷疑皰疹性腦炎。
(1)腦脊液壓力增高，蛋白質及白細胞輕至中度增加，以淋巴細胞為主；
(2)腦脊液發現多量紅細胞具有診斷價值(但須排除穿刺損傷或蛛網膜下腔出血等類疾病)；
(3)腦脊液標本HSV抗體滴度明顯升高，PCR技術檢出HSV DNA。
(4)部分患者有皰疹病史，尤其是面部皰疹。
(5)患者急性或亞急性起病，先有全身不適或上呼吸道感染的前驅表現，往往起病數日之后才有發熱；
(6)繼而出現意識障礙、精神異常及腦實質受損征象；腦電圖異常，兩側可不對稱，以一側大腦半球明顯；CT及MRI顯示顳葉、額葉出血性壞死灶，或呈腦組織彌漫性病變。