單細胞測序技術的主要流程通常包括以下幾個步驟:
單細胞分離
從組織或細胞懸液中分離出單個細胞。常用的方法包括流式細胞術分選、微流控技術、激光捕獲顯微切割等。
細胞裂解和核酸提取
裂解細胞以釋放其中的核酸(DNA 或 RNA)。
提取和純化核酸,確保其質量和純度適合后續的測序反應。
逆轉錄和文庫構建(對于 RNA 測序)
將 RNA 逆轉錄為 cDNA。
給 cDNA 加上接頭和特定的標簽,構建測序文庫。
擴增(如果需要)
對構建好的文庫進行擴增,以獲得足夠的量用于測序。
測序
將制備好的文庫加載到測序平臺上進行測序。常見的測序技術包括二代測序(如 Illumina 測序)和三代測序(如 PacBio 或 Oxford Nanopore 測序)。
數據分析
對測序得到的大量數據進行處理和分析。
包括質量控制、序列比對、基因表達定量、細胞聚類分析、差異表達基因鑒定等。
結果解讀和生物學解釋
根據數據分析結果,解釋單細胞的基因表達模式、細胞類型鑒定、細胞間的異質性等生物學現象。
需要注意的是,不同的單細胞測序技術和實驗方案可能在具體操作上會有所差異,但總體流程大致相似。
細胞凋亡的調控失常是腫瘤發生的標志性事件之一,多種抗癌藥物通過與細胞膜相互作用觸發腫瘤細胞凋亡。在此過程中,細胞膜微環境的變化及代謝重編過程,可通過脂質組學進行精確表征。但由于單細胞尺寸小且群體內部脂......
近日,我所生物分子結構表征新方法研究組(1822組)王方軍研究員團隊和化學反應動力學全國重點實驗室基元反應動力學研究組(1111組)肖春雷研究員團隊,聯合廈門大學杭緯教授團隊、深圳先進光源研究院殷志斌......
為促進細胞生物學,成像技術和單細胞技術融合創新和交流發展。CSCB和橫河電機生命科學組織了“從單細胞到全景組學:高內涵技術的突破性拓展與應用”分論壇。屆時將邀請袁霞教授(北京大學),JONATHANS......
中國農業大學動物科學技術學院教授孫東曉團隊構建了覆蓋奶牛59種組織、179萬個細胞的多組織單細胞表達圖譜,為解析牛重要性狀遺傳調控機制、推進精準育種及探索人類疾病的牛模型研究提供了重要資源。9月5日,......
廈門大學教授史大林團隊基于在西北太平洋副熱帶流渦區開展的高分辨率觀測,定量分析了固氮生物群落的豐度、結構和固氮速率,進而應用廣義加性模型刻畫的優勢固氮藍藻的生態位特征預測了其在全球海洋的主要分布格局,......
得益于雙子葉模式植物擬南芥和單子葉模式植物水稻的遺傳學研究,植物發育生物學在過去40年取得了長足發展。植物分生組織(干細胞)的建立與維持機制、重要組織和器官的分化軌跡及其核心調控網絡已初步建立。這些基......
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員林達等報道了新開發的單細胞多組學技術——Uni-C。該方法可在一個細胞中同時解析基因組大尺度結構變異(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突變(SNP/I......
記者楊舒從中國農業科學院生物技術研究所獲悉,該所作物耐逆性調控與改良創新團隊日前聯合國內外研究機構,構建了首個水稻的多器官單細胞多組學圖譜,系統解析了水稻不同細胞類型的功能及其對復雜性狀的調控作用,有......
作為當前生物醫學研究的前沿熱點領域,單細胞蛋白質組學通過在單細胞層面上探索蛋白質表達模式,精確揭示細胞異質性,為解碼生命過程和疾病發生機制提供了獨特視角,已成為賦能精準醫療和生物醫藥創新的關鍵技術,是......
BeaconDiscovery?單細胞功能表征平臺將幫助研究者解鎖活體單細胞功能分析的全部潛力。它采用Beacon?的光電定位(OEP)和微流體芯片光技術,使研究人員能夠實時探索多模態和動態細胞反應,......