單細胞蛋白具有以下優點：
第一、生產效率高，比動植物高成千上萬倍，這主要是因為微生物的生長繁殖速率快。
第二、生產原料來源廣，一般有以下幾類：①農業廢物、廢水，如秸稈、蔗渣、甜菜渣、木屑等含纖維素的廢料及農林產品的加工廢水；②工業廢物、廢水，如食品、發酵工業中排出的含糖有機廢水、亞硫酸紙漿廢液等；③石油、天然氣及相關產品，如原油、柴油、甲烷、乙醇等；④H2、CO2等廢氣。
第三、可以工業化生產，它不僅需要的勞動力少，不受地區、季節和氣候的限制，而且產量高，質量好。
