從急慢性氣管炎、支氣管炎、肺炎，尤其是原有免疫力低下的基礎病的情況下(如結締組織病，敗血病等)，從痰及氣道分泌物中可分離到卡他莫拉菌。直到20 世紀80 年代，一直認為該菌是健康人上呼吸道的正常菌群。此后在下呼吸道發現該菌，在人們逐漸提高了對條件致病菌、常在菌認識的基礎上，認為該菌也可是一個致病菌。上呼吸道是該菌寄居地和引起感染的侵入門戶，也有報道說它是人生殖道菌群的一部分。
