（1）血清甲胎蛋白（AFP） 患者血清中AFP比卵巢卵黃囊瘤低，可能是因為未成熟畸胎瘤的內胚層組織也可分泌少量AFP，另一可能是生殖細胞惡性腫瘤有不少是混合類型。未成熟畸胎瘤中可能混有少量卵黃囊瘤成分，可合成微量AFP。
（2）神經細胞特異性烯醇化酶（NSE） 卵巢未成熟畸胎瘤含有成熟或未成熟的神經細胞，有時血清內可測出NSE，對本病的診斷有參考意義。
（3）其他 B超、CT、MRI、腹腔鏡、組織病理學檢查。
