三、操作步驟
(一)取材、冰凍切片:
將動物以3%戊巴比妥鈉麻醉,打開胸腔,暴露心臟,刺破右心耳,將針尖刺入左心室用生理鹽水灌注(灌注量約為動物體重的2倍),再注入等量的4%多聚甲醛。(見圖2-7)。取材,置于4%多聚甲醛中后固定4hr。以0.1M
PBS浸泡沖洗4-5次(換液:1次/hr)。將組織塊入30%蔗糖/0.1M
PBS液(4℃),1-2天后冰凍切片,將切片裱貼于原位雜交專用玻片上,切片厚度為15-20μm。
(二)探針制備與檢測(定量):
1.隨機引物制備cDNA核酸探針
以DIG DNA 標記檢測試劑盒為例:
(1)探針制備:
①模板DNA(0.5-3μg) 15μl,100℃變性10min,冰浴5 min。
②在冰浴中加:Hexanucleotide mix 2μl, dNTPmix 2μl, Klenow Enzyme 1μl,反應總體積為20μl。37℃孵育過夜。
③在上述20μl的標記產物中加4M
LiCl 2.5μl, 75μl(無水乙醇預冷),輕輕混勻,-20℃放置 2hr。4℃離心12000g×15min,棄上清。70%乙醇(預冷)
50μl洗滌,7500g×5min,棄上清,晾干沉淀,加TE 50μl溶解沉淀,-20℃保存備用。
(2)探針敏感性檢測:
①樣品稀釋:取dig-標記探針1μl 用ddH2O以1:10、1:100、1:1000、1:1000、1:10000梯度稀釋。
②取一張與點樣器大小相近的尼龍膜,標記方向,ddH2O中浸泡 1min,6×SSC中浸泡10min,置點樣器上,負壓抽吸5min。
③將上述樣品點于尼龍膜上,繼續抽吸10min。
④取下尼龍膜,置紫外燈下10cm處照射5min,晾干。
⑤將膜置于適量預雜交液(5-10 ml)中,37℃預雜交10min。
⑥加入Anti-dig 抗體(1:5000),37℃雜交30min。
⑦洗膜:2×SSC/0.1%SDS室溫洗10 min×2次。
⑧顯色:15 mlTSM2中加300μl顯色液(NBT/BCIP),37℃避光顯色30min。
1. PCR法制備cDNA核酸探針:
(1) 探針制備:
以PCR DIG Probe Synthesis Kit 為例:
在0.5ml離心管中,依次加入:
PCR 引物 1(10pM) 2μl
PCR 引物 1(10pM) 2μl
質粒DNA 模板(10-100pg) 2μl
PCR DIG mix 2μl
(含dNTP和DIG-11-dUTP)
dNTPmix 2μl
10×PCR buffer 5μl
Taq 酶(2u/μl) 1μl
加入適量ddH2O,使總體積達50μl。
① 將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執行擴增。一般:在93℃預變性3-5min,進入循環擴增階段:93℃ 45s → 58℃ 45s → 72℃ 60s,循環30-35次,最后在72℃ 保溫7min。
②
在上述PCR產物中加入4M LiCl 12.5μl、預冷無水乙醇375μl,輕輕混合后置于-20℃2hr,
12,000g×15min,棄上清。70%乙醇(預冷) 120μl洗滌沉淀,離心7500g×5min,棄上清,晾干沉淀,加TE
50μl溶解,-20℃保存備用。
(2)探針檢測:
行瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下觀察DIG-DNA探針含量(采用目測法)。
(三)原位雜交反應(以DIG-cDNA探針為例):
1.0.1M PBS (pH 7.2) 浸 5-10min。
2.0.1M甘氨酸/0.1M PBS 浸5min。
3.0.3%TritonX-100/0.1M PBS 浸10-15min。
4.0.1M PBS 洗 5min×3次,加蛋白酶K(1μg/ml),37℃孵育30 min。
5. 4%多聚甲醛浸5min。
6. 0.1M PBS 洗 5min×2次,浸入新鮮配制的含0.25%乙酸酐/0.1M三乙醇胺中10min。
7.預雜交:滴加適量預雜交液,42℃ 30 min。
1. 雜交:傾去預雜交液,在每張切片上滴加10-20μl雜交液(將探針變性后稀釋在預雜交液中,0.5 ng/μl ),覆以蓋玻片或蠟膜,42℃ 過夜。(陰性對照
2. 洗片:
(1) 4×SSC、2×SSC、1×SSC、0.5×SSC 37℃各洗20min;
0.2×SSC 37℃洗10min;0.2×SSC與0.1M PBS各半洗10min;
0.05M PBS 洗 5min×2次。
10.3% BSA/0.05M PBS 包被,37℃ 30min.
11. 滴加抗地高辛-抗血清堿性磷酸酶復合物(以抗體稀釋液1:5000稀
釋)4℃孵育過夜。
12. 0.05M PBS洗15min×4次; TSM1 10min×2次; 新鮮配制TSM2 10min×2次。
13. 顯色:在玻片上滴加適量顯色液,4℃避光過夜。
14. 將玻片置于TE中10-30min以終止反應。酒精梯度脫水、二甲苯脫脂,中性樹膠封片。
15.顯微鏡下觀察結果。四、注意事項:
1. 作為DNA-RNA的雜交,需防RNase的污染。
cDNA探針在雜交時必須變性解鏈。具體方法是:將探針置100℃加熱5min,冰浴驟冷。