干擾的主要情況可分為難解離化合物生成和陰離子干擾兩種。
首先,待測元素與其他組分反應生成難解離的穩定化合物,該反應發生于溶液中,會使溶液中的游離基態原子濃度降低,從而影響所測元素的吸光度。有些物質在火焰的作用下,會形成難溶的氧化物、碳化物等物質,也會造成參與吸收輻射光的基態原子數減少,吸光度降低。
其次,陰離子的存在會對火焰中的金屬原子產生影響,進而影響所測元素的原子化。