① 核質與細胞質之間無核膜因而無成形的細胞核(擬核或類核);RNA轉錄和翻譯同時進行。
② 遺傳物質是一條不與組蛋白結合的環狀雙螺旋脫氧核糖核酸(DNA)絲,不構成染色體(有的原核生物在其主基因組外還有更小的能進出細胞的質粒DNA);
③ 以簡單二分裂方式繁殖,不存在有絲分裂或減數分裂;
④ 沒有性行為,有的種類有時有通過接合、轉化或轉導,將部分基因組從一個細胞傳遞到另一個細胞的準性行為(見細菌接合);
⑤ 沒有由肌球、肌動蛋白構成的微纖維系統,故細胞質不能流動,也沒有形成偽足、吞噬作用等現象;
⑥鞭毛并非由微管構成,更無“9+2”的結構,僅由幾條螺旋或平行的蛋白質絲構成;
⑦ 細胞質內僅有核糖體而沒有線粒體、高爾基體、內質網、溶酶體、液泡和質體(植物)、中心粒(低等植物和動物)等細胞器;
⑧ 細胞內的單位膜系統除藍細菌另有類囊體外一般都由細胞膜內褶而成,其中有氧化磷酸化的電子傳遞鏈(藍細菌在類囊體內進行光合作用,其他光合細菌在細胞膜內褶的膜系統上進行光合作用;化能營養細菌則在細胞膜系統上進行能量代謝);
⑨ 在蛋白質合成過程中起重要作用的核糖體散在于細胞質內,核糖體的沉降系數為70S;
⑩ 大部分原核生物有成分和結構獨特的細胞壁等等。總之原核生物的細胞結構要比真核生物的細胞結構簡單得多。
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