雙目顯微鏡是指可以兩個眼睛同時觀察的顯微鏡。隨著科學技術的發展，人們發覺用一個眼睛觀察很不方便也別扭，于是就誕生了雙目顯微鏡，也就是二只眼睛同時觀察，同時還有三目顯微鏡，第三目通常是用來連接視頻成像設備的，也就是把鏡下的圖片拍攝下來就行保存。
雙目觀察已成為現代目視儀器的特點，其作用是不象單眼觀察那樣長時間工作而感到疲勞。在大型生物顯微鏡和金相顯微鏡中，一般都用分象系統實現雙目傾斜觀察。
