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  • 發布時間:2019-03-25 20:52 原文鏈接: 雙脫氧法DNA測序實驗——測序酶進行標記測序反應

    在基本的雙晩氧測序反應中,寡核苷酸引物退火于單鏈DNA摸板,在4種脫氧核糖核酸三磷酸存在時,引物為DNA聚合酶所延伸。反應混合物中也含有4種雙脫氧核糖核苷三磷酸的其中一種,當它摻入到DNA的生長鏈時,可終止鏈的延伸。


    實驗材料

    DNA

    試劑、試劑盒

    寡核苷酸引物測序酶終止混合液測序酶緩沖液焦磷酸酶混合液

    儀器、耗材

    離心機離心管微量滴定板

    實驗步驟

    1.  對于每個單鏈模板:將下列試劑混合于0.5 ml 微量離心管中

    (1)0.5 pmol 單鏈DNA模板

    (2)0.5 pmol 引物

    (3)1 μl 10×測序酶緩沖液

    (4)加水至10 μl


    (5)用吸管上下抽吸輕輕混勻(避免產生氣泡)。于65℃溫育6 min,然后于37 ℃溫育20 min,轉到步驟3。

     

    2.  對于每個雙鏈DNA模板:以下列混合液重溶含0.5 pmol 變性雙鏈模板的干燥沉淀物。


    (1)1 pmol 引物

    (2)1 μl 10×測序酶緩沖液

    (3)加水至10 μl


    (4)用吸管上下抽吸輕輕混勻(避免產生氣泡),于37℃溫育30 min,然后在此退火溫度下放置直至進行步驟3。

     

    3.  當引物正和模板退火時,對應每個待測模板,分別標記好A、C、G、T 4個微量離心管。

     


    DNA測序用酶的特性

     

    3.  分別加入2.5 μl A、C、G、T 測序酶終止混合液至A、C、G、T管的底部


    4.  在臨用前,才用測序酶稀釋液稀釋測序酶/焦磷酸酶混合物至1~ 2 U 測序酶/μl,置于冰浴。

     

    5.  將下列試劑加入已退火的引物和模板中

    (1)2 μl  標記混合物

    (2)0.5~1.5 μl  10 mCi/ml[α-32P]dATP

    (3)2 μl  稀釋的測序酶/焦磷酸酶混合液

    (4)總體積在14.5~16 μl,于25℃(室溫)溫育5 min。

     

    6.  加入3.5 μl 標記反應物至含測序酶終止混合物A的微量離心管中。

    7.  用吸管上下抽吸輕輕混勻,對 A、C、G、T 管重復此過程,每次均需更換吸頭,于37℃溫育5~10 min。

     

    8.  加入4 μl 終止/加樣染料液,于95℃水浴2 min,然后置于冰浴。

    9.  每樣品各取2~3 μl 加樣于測序膠進行凝膠電泳并讀出序列。


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