在發表于《自然》（Nature）雜志上的一篇研究論文中， 由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現，采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術，可以揭示出兩者轉錄譜的改變。該研究小組描繪了他們的技術、該技術如何更多地幫助了解細菌感染機制，以及在研究中獲得的重要發現。
Eunice Kennedy Shriver國家兒童健康與人類發育研究所的Matthias Machner和Gisela Storz，在同一期的Nature雜志上發表了一篇"新聞與觀點"（News and Views）文章介紹這項研究工作。
Machner和Stortz表示，以往大多數的研究想更好地了解細菌感染宿主時發生的事件，都是將焦點放在細菌或是宿主的信使RNA上。在這項新研究中，研究人員采用了一種技術使得能夠同時聚焦兩者，從而能夠獲得感染初期階段和后期階段發生事件更完整的圖像。
這一稱作為雙RNA測序（dual RNA-seq）的方法，使得研究人員能夠同時研究宿主轉錄物和病原體信使RNAs——在這里，他們研究的對象是感染一種人類細胞系的沙門氏菌。更特別地是，他們將焦點放在了一種叫做PinT的小RNA上，眾所周知在細菌開始感染宿主細胞時PinT會激活。更細致的觀察揭示出它還調控了腸道沙門氏菌的一些基因，并有一些跡象表明它影響了宿主轉錄模式，轉而導致了一些長鏈非編碼RNAs發生改變及激活了宿主細胞中其他一些信號通路。
研究人員解釋道，這種雙RNA測序方法對細菌進行了綠色熒光標記，使得在宿主細胞受到感染時能夠鑒別出細胞的一些部位。這一技術允許隨著感染病程的發展研究來自兩種生物的信使RNA和非編碼RNAs轉錄物，以前所未有的角度觀測了這一過程。該研究小組的研究還記錄闡明了感染過程中的小變化如何傳遍整個宿主系統，以及導致感染宿主不同結局的過程。