1、預處理加藥問題
（1）絮凝劑和助凝劑的加藥問題：
源水的濁度、PH值、鐵離子的含量以及后續系統的加藥品種等因素決定絮凝劑和助凝劑的加藥品種和加藥量的多少。且加藥量一定要做適應性和加藥量優化試驗。
（2）殺菌劑的加藥問題
對于原水中存在有機物和細菌微生物的水源，一般情況下用戶常采用加氧化性介質進行殺除。對于有些地表性水源，長期投加發現生物抗藥性使得殺菌效果很不理想，投加非氧化性殺菌劑則殺除效果更持久，且可節省后續還原劑投加費用。
（3）還原劑的投加
還原劑的投加要照顧到還原效果，同時要考慮過度投加后的細菌污染。常發現用戶投加過度后，濾芯上的細菌粘泥物生成。
2、RO進水SDI超標問題
（1）工程設計時工藝選擇錯誤的因素：
工程設計系統選擇的失誤導致的污染指數不合格的現象時有所見，解決的辦法是改造預處理系統。
（2）預處理加藥量的不適
對于原水PH超過8的水源，絮凝劑的過量添加急易導致無機膠體的生成，從而導致SDI超標。
（3）過濾效果差
過濾效果差的原因有很多，如：截止濾料品種的選擇、裝填量的不合理、過濾器的周期反洗擦洗時間控制不合理等都會導致SDI高。
3、有機物降除率低問題
（1）完善預處理工藝，提升系統降COD的措施。
（2）嘗試更換其他非氧化殺菌劑進行COD的殺除。
（3）活性炭過濾器的濾料吸附COD飽滿時進行更換或再生。