反相鍵合相色譜儀分離的疏溶劑理論認為非極性烷基鍵合相是在硅膠表面蒙覆了一層以Si－C鍵化學鍵合的十八烷基（或其它烴基）的分子毛。溶質分子（分析物）有非極性部分和極性官能團部分組成。當溶質分子的非極性部分與極性溶劑接觸時，相互間產生斥力，此現象稱為疏溶劑。當溶質分子的極性部分與極性溶劑接觸時，相互間具有親和力。當鍵合相表面的烷基（分子毛）與極性溶劑接觸時，相互間產生斥力。而當溶質分子的非極性部分與鍵合相表面的烷基（分子毛）接觸時，則相互間產生締合作用。這種締合作用是可逆的，締合作用的強弱決定溶質分子色譜保留的強弱。
影響溶質保留值的因素：
1、溶質分子結構：
在一定的洗脫液和溫度下，溶質分子的logk與溶質分子中的非極性部分的總表面成正比。
溶質分子中非極性部分相同，增加極性基團，因為增加了溶質分子與洗脫液的極性分子間的作用力而使k減小。
2、烷基鍵合相特性：
烷基數量越多，溶質保留越強。
烷基碳鏈越長，溶質保留越強。
隨著烷基碳鏈的增長，增加了鍵合相的非極性作用的表面積，其影響溶質的保留值和色譜柱的選擇性（即隨烷基碳鏈的增長，其對溶質分離的選擇性增大）。
3、流動相性質：
流動相的表面張力越大，解締合時釋放的能量越多，k越大。
流動相極性越大，表面張力越小，k越小。
4、溫度：
溫度升高，保留值降低，柱效提高。