根據發酵的特點和微生物對氧的不同需要，可以將發酵分成若干類型：
1，按發酵原料來區分：糖類物質發酵、石油發酵及廢水發酵等類型。
2，按發酵產物來區分：如氨基酸發酵、有機酸發酵、抗生素發酵、酒精發酵、維生素發酵等。
3，按發酵形式來區分，則有：固態發酵和液體深層發酵。
4，按發酵工藝流程區分則有：分批發酵、連續發酵和流加發酵。
5，按發酵過程中對氧的不同需求來分，一般可分為：厭氧發酵和通風發酵兩大類型。
