變性高效液相色譜分析法在人類基因組單核苷酸多態性檢測中的應用

[摘　要]　目的: 檢測白種人和漢族人RDH8 基因序列中單核苷酸多態性(SN P) 位點, 探討變性高效液相色譜分析法(DHPLC) 在基因組研究中的效能。方法: 建立8 個由白種人和漢族人基因組DNA 組成的混合樣品池, 并進行PCR 擴增。其產物以DHPLC 檢測, 發現雜合子信號后, 對單獨DNA 樣本進行DHPLC 檢測及直接測序確定其突變類型。以DHPLC 結合DNA 樣本混合技術在150 個漢族人和20 個歐洲白種人樣本中測定SN P 的基因頻率。結果:在RDH8 基因中共檢測到17 個SN P, 其中12 個為新發現的, 5 個為已報道的; 11 個SN P 在篩查階段發現, 6 個在基因頻率檢測階段發現; 2 個僅在白種人樣本中檢測到, 3 個SN P 的MA F 在兩種人種間有較明顯的差異; 漢族人基因頻率檢測確定了7 個常見SN P。結論:DHPLC 能有效地用于基因組SN P 的檢測, 結合DNA 混合技術, 更能提高其檢測效力, 有效地應用于基因頻率的測定。