植物疫苗
轉基因植物生產疫苗 轉基因植物工程是綜合性的工程，尤其在疫苗研究方面，要想在FMDV轉基因植物疫苗上取得實際的應用價值，還有較長的路要走，這不僅需要對 分子生物學相關方面的深入研究，而且還要對FMDV的免疫機理，尤其是對黏膜免疫的分子機制有全面地認識。可喜的是，許多科學家都在致力于該方面的研究并且取得了一定的成果，相信在不久的將來，適用的 口蹄疫轉基因植物疫苗會更貼近于實際應用。
由于轉基因植物基因工程疫苗具有許多優點因此，其研制與應用引起了許多國家和企業界的重視，顯示出作為低成本苗生產系統的良好發展前景。目前，轉基因植物疫苗的研究報道主要集中在少數植物上，由于 煙草含有毒的生物堿， 馬鈴薯不適合人類生食，這兩種轉基因植物作為人用疫苗來說，顯然是不合適的，因此，開發和應用人類喜歡的，可生食的植物種做轉基因宿主，是當前研制人用轉基因植物疫苗的一個很重要的方面，近來發展的針對人用疫苗的香蕉轉化體系，對外源基因在香蕉果實中高效表達的條件進行了研究，是一個有益的探索。
動物疫苗
對動物疫苗來說，其首選 宿主應是作為飼料的谷類，如苜蓿，玉米和豆類等作物。預計未來的轉基因宿主將呈現多樣化的局面，以滿足不同的人,不同的動物的需求。生物技術通報Biotechnology Bulletin 2002年第2期對于抗原基因來說，只要基礎研究好，市場前景廣闊的均可進行研究，但其重點應首先放在研究胃腸道傳染病上，因為從技術上來講容易獲得突破，從實際上來講其應用價值也最大，特別是動物可飼疫苗的研制，應先行一步。