①節段性的無功能：由于腎盂輸尿管交界處或上段輸尿管有節段性的肌肉缺如、發育不全或解剖結構紊亂，影響了此段輸尿管的正常蠕動，造成動力性的梗阻。此種病變如發生在輸尿管膀胱入口處，則形成先天性巨輸尿管，后果為腎、輸尿管擴張與積水。
②內在性輸尿管狹窄：大多發生在腎盂輸尿管交界處，狹窄段通常為1～2mm，也可長達1～3cm,產生不完全的梗阻和繼發性扭曲。在電子顯微鏡下可見在梗阻段的肌細胞周圍及細胞中間有過度的膠原纖維，久之肌肉細胞被損害，形成以膠原纖維為主的無彈性的狹窄段阻礙了尿液的傳送而形成腎積水。
③輸尿管扭曲、粘連、束帶或瓣膜橛結構，此可為先天性也可能為后天獲得，常發生在腎盂輸尿管交界處、輸尿管腰段，兒童與嬰兒幾乎占2/3。
④異位血管壓迫約1/3，為異位的腎門血管，位于腎盂輸尿管交界處的前方。其他有蹄鐵形腎和胚胎發育時腎臟旋轉受阻等。
⑤輸尿管高位開口：可以是先天性的，也可因腎盂周圍纖維化或膀胱輸尿管回流等引起無癥狀腎盂擴張，導致腎盂輸尿管交界部位相對向上遷移，在術中不能發現狹窄。
⑥先天性輸尿管異位、囊腫、雙輸尿管等。