陽性家族史、雙側發病及發育不完全的后彈力膜組織學發現，支持后部多形性營養不良是遺傳性疾病，最可能假設是角膜內皮細胞或其基底膜遺傳缺陷，并受到下列發現的支持：①異常的后彈力膜后膠原層（非帶狀），提示內皮細胞在胎兒后期或出生后早期已開始變化（重組和最后分化）。②曾發現本病與其他先天性疾病聯系，如圓錐角膜和Alport綜合征，提示可能是基底膜遺傳缺陷。③迷走的角化細胞群進行性替代內皮細胞，這些失去功能的變性角化細胞具有異常的超微結構和上皮樣細胞的特點，包括微絨毛、少量線粒體、胞質內角蛋白絲和橋粒接觸等。這些細胞與后彈力膜小的環狀病變（伴有周圍混濁）有關。④多數研究認為異常細胞具有上皮樣細胞特點，可能起源于角膜內皮細胞并經過化生過程，或對其基底膜變化的一種反應。然而，在PPD角膜移植術后復發的角膜標本研究中提出本病缺陷也許不在內皮細胞本身，而是在細胞周圍的微環境尤其是房水。