含汞廢水主要來源于有色金屬冶煉廠、化工廠、農藥廠、造紙廠、染料廠及熱工儀器儀表廠等。從廢水中去除無機汞的方法有硫化物沉淀法、化學凝聚法、活性炭吸附怯、金屬還原法、離子交換法和微生物法等。
一般偏堿性含汞廢水通常采用化學凝聚法或硫化物沉淀法處理。偏酸性的含汞廢水可用金屬還原法處理。低濃度的含汞廢水可用活性炭吸附法、化學凝聚法或活性污泥法處理，有機汞廢水較難處理，通常先將有機汞氧化為無機汞，而后進行處理。
各種汞化合物的毒性差別很大。
元素汞基本無毒；
無機汞中的升汞是劇毒物質，有機汞中的苯基汞分解較快，毒性不大；
甲基汞進入人體很容易被吸收，不易降解，排泄很慢，特別是容易在腦中積累。
毒性最大，如水俁病就是由甲基汞中毒造成的。