指和順式作用元件結合的可擴散性蛋白，包括基礎因子，上游因子，誘導因子。
真核生物的轉錄調控是調控的最重要的途經，大多是通過順式作用元件和反式作用因子復雜的相互作用而實現的。順式作用元件（cis-actingelement）存在于基因旁側序列中能影響基因表達的序列，它們的作用是參與基因表達的調控，本身不編碼任何蛋白質，僅僅提供一個作用位點，要與反式作用因子相互作用而起作用。啟動子存在著很多順式元件，可分為以下四種類型：①核心啟動子成分，如TATA框；②上游啟動子成分，如CAAT框，GC框，ATF結合位點；③遠上游元件：如增強子，沉默子等；④特殊啟動子成分：如淋巴細胞中的Oct（octamer）和κB。這些元件都為不同的轉錄因子及蛋白質識別和結合來調節轉錄。