喹諾酮類藥是人工合成的抗菌藥，這類藥的共同特點是抗菌譜廣，抗菌活性強，體內分布廣，血漿半衰期較長，不良反應較少且輕。但隨著臨床上的大量使用喹諾酮類藥物，不良反應的報告也逐漸增多，較常見的不良反應有：
①消化道反應：常見惡心、嘔吐、腹痛腹瀉、食欲減退等。以環丙沙星、培氟沙星為多見；
②過敏反應：在使用喹諾酮類藥物時較為常見，主要表現有紅斑、蕁麻疹、皮疹、搔癢等。靜脈輸液時發生較多，所以應密切注意輸液患者的反應；
③中樞神經系統不良反應：有頭暈、頭痛、情緒不安、煩躁、失眠、眩暈等，有中樞神經系統病史者，尤其是有癲癇病史的患者不宜使用此類藥；
④軟骨關節損害：所有氟喹諾酮類由于在未成年動物可引起關節病，在兒童中引起關節痛及腫脹，故不應用于青春期前兒童或妊娠婦女。
⑤光毒性：也是氟喹諾酮類藥物嚴重的不良反應，主要是取代基上有鹵素取代，而表現出很強的光敏性，所以在使用此類藥物的注射劑時，要避光，口服氟喹諾酮類藥，患者要避免陽光或紫外線的照射；
⑥心臟毒性：主要表現在 Q—T 時間延長 ，有嚴重心臟病史的患者慎用此類藥；
⑦肝腎損害：喹諾酮類藥物也可引起肝腎損害，長時間使用，要定期檢查肝腎功能。
⑧血液系統：血液系統的不良反應也時有發生，有報道患者出現白細胞減少病例。