一般而言，嗅覺的障礙常不引起人們的注意，特別是單側的嗅覺缺失，但是臨床上這種單側的嗅覺喪失，在早期診斷上具有重要的定位意義。
流行性感冒、上呼吸道感染的早期，由于鼻黏膜的充血與分泌物增加，出現暫時的嗅覺降低，導致呼吸性的嗅覺減退；病程進展若有嗅神經的損害，則產生神經性的嗅覺降退。但是對于刺激性的物質如稀氨溶液(氨水)、甲醛溶液(福爾馬林)、醋酸等的刺激能夠感受。
癔癥引起的癔癥性嗅覺障礙對于以上物質則不能正常鑒別。
腦膜瘤、轉移瘤、前顱凹動脈或額葉的浸潤性腫瘤，可壓迫嗅球和嗅束導致嗅覺損害，嚴重者嗅覺喪失。Foster-Kennedy綜合征表現為患側嗅覺喪失、同側視神經萎縮，對側視盤水腫。
顱內的炎癥、腫瘤、外傷等病變，累及到刺激嗅覺中樞(位于鉤回、海馬、杏仁核等附近)時，能導致嗅幻覺的產生(hallucination of smell)，患者能發作性地嗅到一種難聞的氣味。
在癔癥與精神疾病的患者中，也可出現嗅覺的異常與嗅幻覺發作。
而嗅幻覺也常是顳葉癲癇的先兆。嗅幻覺如果伴隨意識喪失或咂嘴、咀嚼、舔舌等癥狀，成為鉤回發作(uncinate attack)。因為嗅神經與雙側的鉤嗅中樞有聯系，所以一側嗅放射或嗅覺皮質遭受破壞時，不引起嗅覺的喪失，但是能引起嗅覺的減退。
曾有嗅球或嗅束損傷時出現嗅覺倒錯的報道，但嗅覺倒錯通常源于顳葉病變。故而臨床上常合并有顳葉病變的其他表現，如顳葉鉤回腫瘤可出現同側象限偏盲。
嗅球和嗅束的炎癥或神經性病變較少見，但這些結構可能受腦膜炎或多發性周圍神經炎的影響。如糖尿病病人可能會有嗅覺損傷，遺傳性共濟失調性周圍神經炎患者，早期常見嗅覺減退或嗅覺缺失。
嗅覺過敏病人較少見，但根據曾經報道的病例，病人對嗅覺刺激十分敏銳，以致成為不適的根源。這種情況通常屬于精神癥狀。