篩選治療嗜水氣單胞菌藥物的試驗，都是用先從病體標本的肝、腎、脾等內臟分離出嗜水氣單胞菌作為試驗菌株，通過供試藥物的抑菌試驗，篩選出敏感藥物，再經臨床應用檢驗，對選定藥物的療效和實用性進行綜合評價。 已證實，高敏感類的藥物有：慶大霉素、卡那霉素、氟哌酸、妥布霉素、菌毒清、大黃和五倍子等；中敏感類有：呋喃唑酮、呋喃那斯、氯霉素、復方新諾明、黃苓、連翹、黃柏、二氯、三氯和二氧化氯等。
