一、高效液相色譜儀基線噪聲
1.重氫燈壽命。當高壓燈的壽命達到時，基線不穩定是由噪聲引起的。氘燈發出的光的強度是不穩定的，正如熒光燈的亮度在其壽命結束時不斷變化一樣。計算使用的時間或查看計時器。現象：基線從上到下不規則變化。
2.如果高效液相色譜儀檢測池內有氣泡，當流動相流動時其引起微小氣泡的抖動，光強度隨光強的變化而變化。去除方法：用吸耳球的任何一部分堵住池中液體的出口。此時，壓力顯示會略微增加。氣泡被壓縮得很小，然后突然松開。氣泡會突然膨脹，隨液體流出，可反復消除。
3.檢測池內的污染。小顆粒與流動相的流動相搖晃，導致吸收值的變化。檢查的方法,用吸耳球吸凈池內液體并且在陽光下，觀察檢測池內情況,有必要時進行清洗。污染物的來源一般是樣品的長期積累,會導致柱填料的流出等。
以上三種情況可以判斷為：當泵停止運行時，可分別觀察參考值R和測量值S的穩定性。方法是分別按下參考鍵和測量鍵，顯示值變化。可以判斷氘燈是否有故障，或者壽命是否已過。如果R值穩定，S值不穩定，則可以判斷池中的氣泡或污染物。
二、高效液相色譜儀的基線漂移
1.流動相溶解的氣體在池中突然減壓，吸收率變化引起氣泡和漂移逐漸增大。
2.環境溫度變化較大，儀器溫度相應變化，功率工作點變化，造成漂移。高效液相色譜儀的流動相和氣缸隨溫度的變化也會引起漂移,盡量減少溫度的變化。
3.柱體長時間連續進入樣品，一些較重的組分緩慢連續流出，形成漂移。此時，需要清洗柱。當緩沖器加入到移動相時，運行結束后清洗不完成，當移動相位打開時也會出現基線漂移現象。
提示上述現象的判斷必須保證積分器,工作站等設備的正常運行。
三、高效液相色譜儀檢測器不能正常調零
1.探測器本身的電路故障，如重氫燈不發光，零按鍵開關觸點發生零調整故障。
2.池體污染嚴重。例如石英板內外的污垢對透射率有很大的阻礙，S值很小，所以調零電路不能工作。
3.流動相本身的質量和緩沖溶液的錯誤成分會引起S值的變化。
4.氘燈壽命、能量降低和S值降低導致非調零。但絕大多數案件都是底線不穩定。
四、高效液相色譜儀靈敏度突然下降
1、檢測波長旋鈕是否指在所需要的波長上。
2、流量是否正確。
3、色譜工作站工作情況是否正常。