研究將利用Illumina Protein Prep解決方案生成關鍵參考數據集
美國加利福尼亞州圣迭戈,2025年1月13日——全球基因測序和芯片技術的領導者因美納(納斯達克股票代碼:ILMN)宣布與deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、葛蘭素史克、強生和諾華公司合作,啟動一項試點蛋白質組學項目,分析來自英國生物樣本庫(UK Biobank, UKB)的5萬份樣本。該試點項目基于因美納即將推出的蛋白質組學檢測方案Illumina Protein Prep?,由SOMAmer?技術提供支持,以新一代測序(NGS)解決方案助力科研界和制藥合作伙伴規模化獲取蛋白質組學洞見。
蛋白質組學為直接觀測細胞功能提供了可能,從而幫助科研工作者深化對蛋白質在健康與疾病中作用的理解,并有助于發現癌癥和心血管疾病等疾病的生物標志物。研究人員使用蛋白質數量性狀位點(pQTLs),這是一種將遺傳變異與蛋白質表達數據和疾病或其他表型相聯系,用于藥物發現的重要蛋白質基因組學工具。隨著Illumina Protein Prep等高通量蛋白質組學方法的出現,新的pQTL的發現變得更加便捷。
“英國生物樣本庫的數據已經成為組學領域的標準參考數據集,在Illumina Protein Prep推出之際,我們很高興能在這一試點研究中與醫療行業合作伙伴開展合作,” 因美納首席技術官Steve Barnard博士表示,“我們相信該試點項目將為科研界和制藥合作伙伴提供一套新的高質量、基于NGS的蛋白質組學數據,以促進生物學洞見的生成。”
英國生物樣本庫將提供5萬份樣本,這些樣本均來自已參與英國生物樣本庫制藥蛋白組學項目(UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)的研究對象,該項目是英國生物樣本庫與14家生物制藥公司之間的一項獨立研究合作。deCODE Genetics將利用Illumina Protein Prep解決方案和NovaSeq? X Plus測序儀對樣本進行處理,并通過DRAGEN蛋白定量分析流程進行分析。首批3萬份樣本的研究由因美納、deCODE Genetics和Standard BioTools, Inc.聯合投資資助,Tecan作為自動化合作伙伴提供相應的支持。這些樣本產生的數據將在2025年下半年完成質量控制后由英國生物樣本庫立即提供給科研界。
對于另外的2萬份樣本產生的數據,根據英國生物樣本庫的標準慣例,行業聯盟成員將擁有一段時間的獨家訪問權。行業參與者包括deCODE Genetics及制藥合作伙伴葛蘭素史克、強生和諾華。在此專屬期結束后,英國生物樣本庫將向更廣泛的科研界提供這些數據。因美納預計將有更多公司加入該聯盟。
英國生物樣本庫首席研究員兼首席執行官Rory Collins爵士、教授表示:“這些日益豐富的蛋白質組學數據將幫助研究人員描繪出一幅更加動態的圖景,呈現個體遺傳、環境和生活方式如何共同影響不同疾病的發展。”
“這一項目補充了英國生物樣本庫制藥蛋白組學項目的工作,在原先項目基礎上提供了額外的蛋白質組學檢測數據。我很期待看到全球科學界如何利用這些不同來源的數據,在預防和治療多種疾病的新方法開發中取得突破性進展。”
“蛋白質組學正在進入一個變革的時代,迄今為止,其在人類健康領域的影響受到傳統技術的限制,” Standard BioTools, Inc.首席執行官Michael Egholm博士表示,“今天標志著一個重要的里程碑,因為我們將頂尖的,具備多種能力的由DNA驅動的SOMAmer技術與領先的NGS平臺無縫集成,進一步釋放英國生物樣本庫的潛力以加速人類健康的發展。”
檢測方法通過11K SOMAmer(慢解離速率修飾適配體)試劑檢測9,000種獨特的人類蛋白質,實現從樣本到分析的蛋白質組學發現研究。這一解決方案已在早期試用中為客戶所用,能夠檢測6,000種人類蛋白質,并與NovaSeq X、NovaSeq X Plus以及NovaSeq 6000測序儀兼容,從而在單一平臺上實現多組學研究。該解決方案計劃于2025年上半年正式推出。
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