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  • 發布時間:2019-03-28 21:28 原文鏈接: 固相化pH梯度雙向凝膠電泳實驗8

    方案8 第二向:蛋白質的 SDS-PAGE 實驗

    實驗方法原理在第一向 IEF 和 IPG 膠條平衡之后,需進行第二向 SDS-PAGE。SDS-PAGE 是基于蛋白質分子量的不同而將其分離的。這種分離系統可從多家供應商處獲得,在許多蛋白質化學實驗室中也普遍使用。這里介紹放置 IPG 膠條的方法以及第二向凝膠電泳條件。
    實驗材料

    已聚焦 IPG 膠條

    試劑、試劑盒

    瓊脂糖密封溶液蛋白質分子量標準5XSDS 電泳緩沖液

    儀器、耗材

    濾紙鉗子和多用尺子溫度控制儀電源SDS-PAGE 凝膠垂直電泳設備

    實驗步驟

    1.在 100°C 加熱瓊脂糖封閉溶液使之熔化。每塊凝膠約需 1ml 溶液。完全熔化瓊脂糖要花 1Omin,最好在即將平衡 IPG 膠條時進行(方案 8)。瓊脂糖熔化后,將其冷卻至 40~50°C。

    2.在第二向凝膠表面的平板之間用鉗子定位平衡后的 IPG 凝膠條,保證塑料支持條靠著其中一塊玻璃平板。在平板之間用一把薄的軟塑料尺子推動 IPG 膠條,直到 IPG 底邊和凝膠表面緊密接觸。從 IPG 膠條一端至另一端逐漸沿玻璃平板推動膠條。為了避免 IPG 膠條被撕破,應在凝膠的塑料支持面施力使 IPG 膠條放入適當位置。

    保證在平板凝膠和 IPG 膠條底邊之間,以及塑料支持和玻璃平板之間沒有氣泡。如果有氣泡,輕壓 IPG 膠條的塑料支持趕走氣泡。如果氣泡在第二. 向凝膠上方,不要過重地壓 IPG 膠條表面,那樣可能會使 SDS-PAGE 凝膠上表面的孔徑縮小。

    3.如果需要分子量標準,將準確劑量的分子量標準(對考馬斯染色來說需 200~1OOOng; 對銀染來說,需 10~50ng) 和已熔化的瓊脂糖封閉溶液混合,吸取 15~20ul 此混合物至一小張濾紙上。

    4.瓊脂糖凝固后,將濾紙夾在兩個玻璃平板之間,以便它在 IPG 膠條末端和平板凝膠上部相連接。

    如果凝膠將用于印跡,用抗生物素蛋白-辣根過氧化物酶或抗生物素蛋白-堿性磷酸酶作蛋白質檢測,可使用生物素酰化標準。所使用的生物素酰化標準量見操作指導手冊。

    5.緩慢吸取溶化的瓊脂糖封閉溶液至 IPG 膠條上,避免產生氣泡。在繼續下述步驟之前,瓊脂糖應冷卻并凝固至少 lmin。

    在瓊脂糖內包埋凝膠條是為了固定膠條使之處于正確位置,確保 IPG 膠條和凝膠之間的良好連接。

    6.按操作指導手冊,完成電泳裝置的安裝。連接冷卻裝置(如果有的話),使其保持凝膠溫度在 10~15°C。

    雖然冷卻不是必需的,但這樣可大大減少凝膠之間的變化,并允許凝膠在高電流下電泳,這樣可減少電泳的時間。

    建議標準和大型凝膠應冷卻,冷卻可大大提高凝膠之間的重復性,有助于減少人為的影響,例如凝膠的「微笑,,條帶。如果在實驗室中溫度有大的波動,冷卻就非常重要了。

    7.按方案中表 7 或表 4.8 中建議的電泳條件來設置電泳儀,打開電源,開始電泳。

    電泳分兩步進行。第一步持續時間較短,使用低電流或低功率設置,使蛋白產生最初的遷移和堆積,在電泳開始 5~15 min 之后(見表 4.7 和表 4.8),檢查溴酚藍是否已進人凝膠;第二步,電流或功率要升高以允許快速分離。

    8.當溴酚藍達到距凝膠底部 0.5~1cm 時,關掉電源,從電泳槽中將凝膠移出。

    9.將凝膠水平放置,除去隔板,小心不要損壞凝膠,用塑料彈性刀片小心將每塊凝膠的兩塊玻璃平板分開。不要用金屬切片,因其會在玻璃板上留下劃痕。凝膠應該貼于其中一面玻璃板。

    10.立即進行凝膠的染色(方案 10~方案 14) 或蛋白質的轉膜(方案 15~16 。

    實驗提示:切忌讓凝膠干燥!如果必要,凝膠留在電泳槽中,繼續完成下一步方案的準備工作。

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